新鲜组织经过固定、取材、脱水、透明、浸蜡后，用特定的包埋模具将前期处理的组织块与融化的石蜡一起包埋成组织蜡块的过程称为组织取材包埋。石蜡包埋不仅是经典的病理实验方法，也是当前临床病理组织的常规储存方式，能够长期保存并维持原始的细胞形态和组织结构。包埋的关键一是平整，二是方位。要求在包埋时，应采用镊子轻压组织块拱起部分，使之平贴于底部，通常采用组织的最大面包埋，囊壁、管腔组织应竖直包埋。特殊组织按特殊要求进行包埋。特殊组织有类器官，斑马鱼，眼球，细胞团，材料组织等。
实验流程：
组织取材-固定-专业再取材-脱水-透明-浸蜡-包埋。
样本要求及运输条件：
提供固定完全的组织样本。组织离体后，选择合适的固定液和容器立即固定，固定液的量建议大于组织体积的10-15倍，固定时间建议24-48h，大标本固定12h，再切开固定。固定完全后尽快送检。标本常温(24℃左右)或冷藏(4℃)固定，切勿冷冻结冰，固定样本常温运输送样。
特殊组织注意事项：
眼球：新鲜眼球取下后迅速放入眼球专用固定液中固定24小时以上，切记不能挤压，否则会影响组织结构完整性。
类器官：较小较软的类器官可以用新鲜制备的4%PFA固定，如肉眼实在不可见，可低速离心。也可以琼脂糖包埋后再进行石蜡包埋保证形态完整。
细胞团：要求细胞量达到离心后肉眼可见细胞沉淀，如果是已经成团的细胞，可以直接用吸管吸出，放在滤纸上，也可以用少量台盼蓝作标识，便于后面包埋。细胞悬液离心去上清留沉淀，沉淀用琼脂糖包埋成块，琼脂块正常脱水包埋。
斑马鱼：每个样本需要多送几条，可以一次多脱几只，包埋时选择形态较好的样本进行包埋，包埋时注意方向要求，不能用镊子直接夹取。
