原位杂交（in situ hybridization，ISH）是指将特定标记的已知序列核酸作为探针与细胞或组织切片中核酸进行杂交，从而对特定核酸序列进行精确定量定位的过程。FISH的实验材料可以是石蜡包埋组织切片、冷冻组织切片、细胞涂片和培养细胞爬片等。
主要用途：
原位杂交的主要目的是检测或定位某一特定的目的DNA或目的RNA的存在，对该目的DNA或RNA进行定性、定量及定位分析，可应用于：
1、细胞特异性mRNA转录的定位，可用于基因图谱、基因表达的研究。
2、受感染组织中病毒DNA/RNA的检测和定位，如EB病毒mRNA、人乳头瘤病毒（HPV）DNA和巨细胞病毒DNA的检测。
3、癌基因、抑癌基因等在转录水平的表达及其变化的检测。
4、基因在染色体上的定位。
5、染色体数量异常和染色体易位等的检测。
6、分裂期间细胞遗传学的研究，如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定等。
检测原理：
将特定标记的已知序列核酸为探针与细胞或组织切片中核酸进行杂交，从而对特定核酸序列进行精确的定量定位。
实验流程：
- 使用预处理试剂处理切片，以暴露靶标RNA。
2、将基因特异性的探针对与目标RNA杂交。
3、探针与级联放大信号分子杂交，在不同的荧光通道中显示不同靶标RNA。
4、使用合适的荧光显微镜观察靶标RNA。
样本要求及运输条件：
1、提供固定合格的样本。组织离体后，立即放入原位杂交固定液中，在室温下固定16-32小时。石蜡切片常温运输。
2、新鲜冰冻组织样本取材后直接用OCT包埋，然后以10-20μm厚度进行切片。切片可以在-80℃保存至多3个月，在此步骤前不要对组织使用任何固定剂（乙醇或甲醛）。切片于干冰中运输。
3、固定组织做冰冻切片，样本取材后应立即放到原位杂交固定液中，4℃固定24小时。切片于-20℃运输。
4、细胞爬片用原位杂交固定液固定15分钟后，换无酶PBS，密封，4℃运输。
5、探针需低温保存，干冰运输。
注意事项：
1、如果客户没有探针，需要公司设计合成的，需提供基因名和种属信息。探针合成不退。
2、若客户提供的探针有对应的杂交缓冲液，请客户提供。若无，则使用公司所用的通用杂交缓冲液。
3、原位杂交实验一般先做预实验然后进行正式实验，因为核酸容易降解，因此前期样本处理有特定要求，具体可与公司沟通。
4、正式实验的趋势我司不做保证。
5、原位杂交实验所用的超纯水、载玻片等实验器具均需要高压灭菌。若为关于RNA的原位杂交，则需要加入DEPC进行高压灭菌。
